Avis de soutenance - doctorat - Antoine GRADEL
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Ecole doctorale 472
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Soutenue par
Antoine GRADEL
Structure génétique, connectivité et adaptation des huîtres perlières Pinctada margaritifera var. cuminguii au sein des archipels de la Polynésie Française
Les huîtres perlières du complexe Pinctada margaritifera sont présentes à l'échelle de l'Océan Pacifique, s'échelonnant de l'Indonésie à la Polynésie Française, et du Queensland jusqu'au Japon. L'aquaculture de l'huître perlière Pinctada margaritifera var. cuminguii pour la perliculture représente la deuxième source de revenu pour la Polynésie française, après le tourisme. Cependant, des problèmes liés à la collecte du naissain rendent cette ressource variable au fil du temps. Pour remédier aux collectes insuffisantes dans certains atolls, des transferts massifs d'individus ont été effectués ces dernières décennies entre atolls, voire entre archipels. Aujourd'hui, populations sauvages et cultivées se côtoient au sein d'un même archipel voire d'un même atoll en Polynésie française. Les changements climatiques et notamment l'augmentation des températures présente également un risque pour la ressource qui vit déjà proche de sa limite thermique.
Cette thèse utilise des technologies innovantes afin de proposer une nouvelle description de la connectivité des populations de P. m. cuminguii au sein de la Polynésie afin d'aider à la définition d'unités de conservation pour assurer le maintien de la diversité génétique le long de l'aire de répartition de l'espèce et pour conserver les acquis génétiques. En effet, au-delà de la caractérisation des niveaux de connectivité, l'identification des acquis génétiques sont importants pour le futur de la perliculture, notamment au regard de la qualité de la perle. Une approche en démographie a également permis d'avoir un premier aperçu de l'histoire passée ayant amenée aux structures génétiques observées aujourd'hui.
L'adaptation locale en lien avec les régimes thermiques est également un sujet important pour le devenir de l'espèce et son exploitation dans le cadre du changement global. L'optimum thermique de P. m. cuminguii (29°C) est dépassé près de 120 jours par ans dans les lagons polynésiens, contribuant à l'apparition d'épisodes de mortalité massive. Cependant, certaines populations d'huîtres sont capable de survivre en zone intertidale, dans des flaques où des variations thermiques de 8 à 10 °C ont pu être mesurées comme aux Marquises. Une expérimentation menée dans le cadre de cette thèse a ainsi mise en évidence l'implication du métabolisme mitochondriale et du bouclier antioxydant dans les processus d'acclimatation/adaptation de l'espèce.
Genetic structure, connectivity and adaptation of pearl oysters Pinctada margaritifera var. cuminguii in French Polynesia
Pearl oysters of the Pinctada margaritifera complex are distributed across the Pacific Ocean, ranging from Indonesia to French Polynesia, and from Queensland to Japan. The aquaculture of the pearl oyster Pinctada margaritifera var. cumingii for pearl farming represents the second-largest source of revenue for French Polynesia, after tourism. However, issues related to insufficient spat collection have made this resource variable over time. To address problems on spat collection in certain atolls, massive transfers of individuals have been carried out in recent decades between atolls, and even between archipelagos. Today, wild and farmed populations coexist within the same archipelago, and even within the same atoll in French Polynesia. Climate change, particularly rising temperatures, also poses a risk to this resource, which already lives near its thermal limit.
This thesis employs innovative technologies to provide a new description of the connectivity of Pinctada margaritifera cumingii populations within French Polynesia, in order to aid in defining conservation units that ensure the maintenance of genetic diversity across the species' range and preserve its genetic assets. Indeed, beyond characterizing the levels of connectivity, the identification of these genetic assets is crucial for the future of pearl farming, particularly with regard to pearl quality. A demographic approach has also provided an initial insight into the past history that has shaped the genetic structures observed today.
Local adaptation related to thermal regimes is also an important issue for the future of the species and its exploitation in the context of global change. The thermal optimum of Pinctada margaritifera cumingii (29°C) is exceeded for nearly 120 days per year in Polynesian lagoons, contributing to episodes of mass mortality. However, some oyster populations are able to survive in intertidal zones, in pools where thermal variations of 8 to 10°C have been recorded, as observed in the Marquesas. An experiment conducted as part of this thesis highlighted the involvement of mitochondrial metabolism in the species' acclimation/adaptation processes.
Directeur de thèse :
Serge PLANES
Unité de recherche :
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement
Membres du jury :
- CoDirecteur de thèse : Serge PLANES , Directeur de recherche (EPHE PARIS)
- CoDirecteur de thèse : Céline REISSER , Cadre scientifique des EPIC (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer)
- Rapporteur : Cécile FAUVELOT , Directeur de recherche (Institut de Recherche pour le Développement)
- Rapporteur : Charlotte CORPOREAU , Cadre scientifique des EPIC (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer)
- Examinateur : Sophie ARNAUD-HAOND , Cadre scientifique des EPIC (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer)
- Président : Nicolas BIERNE , Directeur de recherche (Centre National de la Recherche Scientifique)
Diplôme :
Doctorat Systèmes intégrés, environnement et biodiversité
Spécialité de soutenance :
Biodiversité, génétique et évolution